Il est né le 23 septembre 1956 dans l’État du New Jersey dans une famille juive, fait dont il se sert dans le billet d’humeur qu’il écrit pour le Comic Buyer’s Guide, sorte de magazine sur les sorties de comics.
Il débute sa carrière en écrivant « La mort de Jean DeWolff » pour la série The Spectacular Spider-Man, pour l’éditeur Marvel Comics. Il raconte la mort d’un personnage important et la réaction du héros, Peter Parker.

Marvel lui confie pendant quelques années les scénarios de The Spectacular Spider-Man, de The Incredible Hulk (qui lui vaut en 1992 un Eisner Award) et d’autres séries (Spider-Man 2099, ...). Devenu entre temps freelance (pas de clause d’exclusivité), Peter David écrit également pour DC Comics, notamment des histoires de l’univers d’Aquaman et Supergirl. Peter David est également l'auteur de Sachs and Violens et Hulk: Future Imperfect, deux mini-séries dessinées par George Perez chez Marvel Comics.

Il travailla également pour Dark Horse sur la série SpyBoy et pour DC sur Young Justice, deux séries qu'il fit se renconter en 2002 lors du crossover en 3 épisodes SpyBoy/Young Justice.

De janvier 2000 à septembre 2004, il scénarisa pour Marvel Comics la série Captain Marvel volume 3 puis 4 (60 épisodes en tout), dessinée par Chricross et consacrée aux aventures de Genis-Vell, le fils du premier Captain Marvel, et Rick Jones.

Actuellement, il est l’auteur de Fallen Angel qui après son arrêt par DC doit être reprise par IDW.

Il doit en outre, après quelques épisodes de Hulk, son personnage emblématique, assurer le scénario d'un nouvelle série de Spider-Man, Friendly Neighbourhood Spider-Man avec Mike Wieringo et lancer une nouvelle série X-Factor, titre sur lequel il avait déjà travaillé dans les années 1990. Ce retour fait suite à la récente mini-série Madrox.